一、進口貨物的報關手續貨物不論以何種運載工具運抵日本港口或航空港，一般均卸存于海關指定的保稅區或貨棚，等候海關辦理查驗、納稅、放行手續。漲關對貨物儲存的期限進行限制，超過期限不在存放的外國貨物海關將科以監管金。進口貨物一般由注冊的報關手行代表進口商向海關申報。報關時進口商除交申報單外，必須提交下列單證：
1、進口報單
除了具有進口配額的商品應提交進口許可證外，其他商品只要提交進口報單。進口報單上必須填明貨物的嘜頭、裝貨單號碼、品名、數量價值；貨物的原產地、購買地、起運地載支貨和船只或飛機的名稱、登記標志及國籍。除此，進口商必須聲明：
A進出口雙方有無某種特別關系例如總號與分號總公司與子公司、外國供貨號與訂立獨家經營合同的商號等關系；
B進口商除發原開列的金額外是否必須向出口號方付給予酬謝費；
C進口商是否需向駐日本的出口商代理人支付其他費用；
D進口商是否有義務進行推銷；
E發票所一列的價格是否別的折扣；
F對進口的貨物，除按怪票價格付款外，是否須另付款項或使進口商增加其他負擔。
2、商業發票海關沒有規定特別的形式，但至少需帶有發貨人簽字。商業發票供海關估價之用，必須列明：
A嘜頭號碼名稱貨名全稱、布魯塞爾稅則目錄號列數量：
B商品的總價和單價；
C明細費用，包括運費、保險費和裝運雜費；
D毛、凈重；
E填寫發票的地點和日期；
F目的地和受貨人；
G關于決定貨價的合同條件。
3、裝箱單
4、產地證明書刊號產地證明書一般由當地商會或日本領事館、外交官在商品的生產政府采購、一般買或裝船的地方鄧以認證。
5、提單三份已簽字的正本提單如系空運則為代運單，通常經由銀行轉交，另外到嫠兩分未簽字的副本直接交給予受貨人。實際需要的項目通常在受貨人的信用證中有詳細說明。
6、其他海關體價征稅證
進口商如因某種原因不能呈交發票或因發標上所交資料不足，不能用以估定貨價，海關可調取載有詳細運費保險峰費包裝費及貨價表的書面合同及其他證件。進口貨物如系動植物，同必須符合農林省動植物進口檢疫規則，附有檢驗證書。進口商或春代理人在向海關辦理進口報關的同時，應附交進口稅報單3份。第批貨物應繳納的稅款由進口商蔌其他代理人自行計算并填具在進口稅報為詞通關，進口商慶掌握有關貨物完整詳細的資料若有疑問要要求海關進口，經解答后填報。
二、進口配額和進口管
凡通產省所規定的非自由化商品項目的確定商品者要依照進口配額制度進口。這是一較嚴格的一種配額要求進口先向通關省申請分給予配額外負擔一經獲準即可取得進口配額證這一證件在進口商有權向特許銀行提出申請時，即可自動地取得進出口許可證事實上一切進口配額證都在全球配額基礎上簽發的從不考慮貨不知所云的原產國和應付的貨幣進口貨必須在規定的有效期內由漲尖征稅放行。日本采取最高進口數額和最大國別數額的關稅配額辦法將并享有關稅配額的進口商品劃分為132個產品組然后這將此產品組分成三大類第一類為日控制。屬于這一類商品的進口采用先到先放的辦法給予減免關稅優惠，但商品進口受到監督。受惠國或地區的最大類別數額一旦用完后的第2天其超過期額進口的商品即征收最惠國關稅，屬于這類商品進口辦法類似于第一類商品，但最大國別數額用完后，即在第二個月的第一天起征收最惠國關稅，屬于這類的商品有125組。第三類為預先配額屬于這類商品的進口取勝額其總數的80%，分配給予過去經營該類商品的傳統進口商品糧20%分配給予親的進口商。這類商品為紡織品共計11組。
三、過境和復出口貨物報關手續篇
日本是進口報關手冊暫行公約的簽字國，對所有憑手冊從公約締約國運人日定辦理。外國貨物如從日本復運出口漲關，并向海關呈交出口報單才商業對進口時給予免稅待遇的展覽品專業用工具、私人汽車等，為了免納進口稅在出口時必須賂海關交驗原煤一的免稅進口單暫準免稅進口用于裝配的零件，如與進口記錄查對核實無誤并保持原樣海關準予復出口經通產省和大藏省批準，并采取防止運入國內市場的措施工，人綱物可以免稅運往保稅區，進行加工后復出口。
